Perbedaan sel Prokariotik dengan sel Eukariotik terbagi 6 , yaitu :
1. Ada tidaknya membran inti
- Prokariotik : Tidak punya
- Eukariotik : Punya
2. Ukuran
- Prokariotik : 1-10 mili mikron
- Eukariotik :10-100 mili mikron
3. Bentuk kromosom
- Prokariotik : Sirkuler ( Melingkar )
- Eukariotik : Linear ( Garis )
4. Ada tidaknya plasmid
- Prokariotik : Punya
- Eukariotik : Tidak punya
5. Jumlah RNA
- Prokariotik : Sedikit
- Eukariotik : Banyak
6. Organel penghasil energi
- Prokariotik : Mesosom
- Eukariotik :Mitokondria